Trong nhiều năm qua, công tác bảo vệ chăm sóc sức khoẻ nhân dân và dân số KHH gia đình có tiến bộ. Công tác vệ sinh phòng dịch luôn được quan tâm thường xuyên, không để xảy ra dịch bệnh, phòng chống tốt dịch viêm đường hô hấp cấp, dịch cúm gia    cầm....Mạng lưới y tế từ tuyến cơ sở đến tuyến tỉnh tiếp tục được tăng cường cả về cơ sở vật chất và đội ngũ cán bộ. Chất lượng khám, chữa bệnh ngày càng được nâng lên, thu hút nhiều người dân đến khám và điều trị, các chương trình y tế quốc gia đã triển khai tốt, đạt hiệu quả cao.

          Trong 10 năm qua, do sự thay đổi địa giới hành chính của một số cấp cơ sở nên ngành y tế tỉnh đã chỉ đạo thành lập 2 tuyến y tế tập trung và 3 trạm y tế cơ sở. Theo định hướng của ngành y tế tập trung nâng cấp các khoa, phòng, ban của Bệnh viện Bắc Ninh thành các bệnh viện vệ tinh của Trung ương.

      Số giường bệnh của các cơ sở y tế ngày càng được tăng cường đáp ứng nhu cầu điều trị của nhân dân. Năm 2006 toàn tỉnh có bình quân 19,4 giường bệnh trên 1 vạn dân. Mạng lưới y tế cơ sở của tỉnh với các trạm y tế tuyến xã/phường/thị trấn là chủ yếu đóng vai trò quan trọng, rộng khắp toàn tỉnh. Đến nay 100%   xã/phường/thị trấn đều có bác sĩ và nữ hộ sinh.Số y, bác sĩ trên  1 vạn dân năm 2006 tăng 107% so với năm 1997. Có trên 50% số xã trong tỉnh đạt chuẩn quốc gia về y tế xã.

+ Triển khai chương trình chuẩn y tế Quốc gia: Việc thực hiện các chương trình mục tiêu quốc gia về y tế trong những năm vừa qua đã có nhiều chuyển biến tích cực: Chương trình phòng chống suy dinh dưỡng cho trẻ em dưới 5 tuổi, Chương trình chăm sóc phụ nữ có thai và kế hoạch hoá gia đình, chương trình phòng chống HIV/AIDS, chương trình phòng chống Lao.....